Protein–RNA interactions for Protein: P0DN87

CGB7, Choriogonadotropin subunit beta 7, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB7P0DN87 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CGB7P0DN87 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms