Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VIL1P09327 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIL1P09327 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIL1P09327 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VIL1P09327 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VIL1P09327 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms