Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPSAP08865 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPSAP08865 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPSAP08865 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPSAP08865 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPSAP08865 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPSAP08865 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms