Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PF4P02776 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PF4P02776 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms