Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPTA1P02549 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms