Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTL6BO94805 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms