Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC45O75419 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC45O75419 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms