Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPFIA4O75335 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms