Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEMFO60524 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEMFO60524 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms