Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms