Protein–RNA interactions for Protein: O60304

ZNF500, Zinc finger protein 500, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF500O60304 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF500O60304 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms