Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CXCL13O43927 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms