Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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VEGFDO43915 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VEGFDO43915 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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