Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC28A2O43868 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms