Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARPC1BO15143 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms