Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE40O14503 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHE40O14503 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms