Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIBO00712 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFIBO00712 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIBO00712 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFIBO00712 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFIBO00712 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFIBO00712 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIBO00712 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms