Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBAG9O00559 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms