Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2K7ER74 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2K7ER74 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2K7ER74 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms