Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3KR12 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3KR12 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3KR12 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3KR12 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3KR12 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3KR12 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3KR12 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms