Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L21D6R901 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms