Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L12C9JPN9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms