Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DLN1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DLN1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DLN1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DLN1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DLN1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms