Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP29-1A8MX34 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP29-1A8MX34 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms