Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NOTOA8MTQ0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms