Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SOBPA7XYQ1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOBPA7XYQ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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