Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms