Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf170A2RU37 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms