Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC78A2IDD5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC78A2IDD5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms