Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPDC1A2A3K4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPDC1A2A3K4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms