Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCE3A1L190 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCE3A1L190 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms