Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ARL2-SNX15V9GYD0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms