Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA3Q9Y6Q9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA3Q9Y6Q9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms