Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms