Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF3AQ9Y496 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF3AQ9Y496 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms