Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RHBDD3Q9Y3P4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHBDD3Q9Y3P4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms