Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIT1Q9Y2X7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIT1Q9Y2X7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms