Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVW-1Q9UQF0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms