Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms