Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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