Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGSF9BQ9UPX0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms