Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms