Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHF11Q9UIL8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms