Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAPAQ9P0L0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAPAQ9P0L0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms