Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms