Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM106BQ9NUM4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms