Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKDREJQ9NTG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms