Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG3Q9NT62 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG3Q9NT62 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms