Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER2Q9NSB8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms