Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SERINC1Q9NRX5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC1Q9NRX5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms